In de 25 jaar die volgden na de vaststelling van het bestemmingsplan werd stevig gesloopt, fabrieken, bedrijfspanden, schoolgebouwen, en krakkemikkige woonpanden. Nieuwe betaalbare huurwoningen kwamen er voor in de plaats. Maar ook groengebieden, zoals de Natuurtuin (geopend in 1994), het Thiemepark (geopend in 1999) en het Vondelparkje (aangelegd in 2006). Overigens geen overbodige luxe een wijk die het minste groen had van alle wijken in Nijmegen. De laatste grote klus was de sloop van de Dobbelmanfabriek in 2001 en de daarna volgende herinrichting van het gebied. Zo werd Bottendaal na een lange en harde strijd weer bewoonbaar. Langzamerhand werd de wijk weer de wijk, zoals deze oorspronkelijk bedacht was: een stedelijk gebied waar het plezierig is om te wonen voor iedereen.